Diferentes rutas enlazan Pamplona con otras ciudades españolas por tren. Si vienes desde Madrid, el viaje dura 3 horas y 20 minutos. Si lo haces desde Barcelona, el trayecto dura 5 horas y media aproximadamente. 

La estación de tren de Pamplona se encuentra en el barrio de San Jorge, al noroeste de la ciudad. Hasta la estación llegan dos autobuses urbanos: la línea 9, que conecta con el centro de la ciudad y llega hasta la Universidad Pública de Navarra (UPNA), y la línea 7, que conecta con la zona hospitalaria. Cabe destacar que la línea 9 es atendida por autobuses eléctricos que realizan la recarga en las dos cabeceras de la línea mediante pantógrafos, siendo la Estación de Tren una de ellas.

Así mismo, en el exterior de la estación es posible tomar un taxi. La flota de taxi de Pamplona está gestionada a través de la Mancomunidad de la Comarca de pamplona y es principalmente eléctrica o híbrida. Existen taxis adaptados para personas con movilidad reducida, y para asegurar su disponibilidad es recomendable reservar previamente por teléfono (Telf.: 948232300) o aplicación web.

Como alternativa, se puede utilizar una bicicleta eléctrica de alquiler municipal, desde la base de bicicletas ubicada en el exterior de la estación. Es un sistema enfocado al transporte cotidiano, pero abierto a las personas que nos visitan, que ofrece la posibilidad de hacer uno o más usos: basta con escanear el código QR, descargar la aplicación y coger una bicicleta por 1,10 euros de tarifa de desbloqueo, que incluye 20 minutos de viaje gratuitos.

Caminando, se emplea una media hora para alcanzar la meseta de la ciudad donde se localizan los barrios más céntricos. La Estación de Tren está ubicada en la parte baja junto al río Arga, y existen ascensores urbanos que permiten superar la diferencia de cota.  Desde la Estación las dos mejores alternativas son el recorrido que incorpora el ascensor de Descalzos o el que incorpora el ascensor de Trinitarios.